En raison de l’absence de données toxicologiques, la supplémentation en glucosamine est déconseillée pendant la grossesse ou l'allaitement.
Elle est contre-indiquée chez les personnes étant traitées par des médicaments anti-coagulants.
La prise de glucosamine en cas de diabète est sujet à controverse.
La glucosamine contient bien du glucose, mais comme elle ne peut pas être divisée par l'organisme, ce glucose n'est pas libéré dans le sang. Il semblerait donc qu’il n’y ait aucun lien entre la prise de glucosamine orale et une éventuelle modification du métabolisme de l'insuline.
Par contre la glucosamine, de part sa ressemblance avec le glucose, peut être confondue par les appareils de mesure et donner de faux résultats positifs. A consommer donc avec prudence par les personnes diabétiques. Il est conseillé de prévenir son médecin pour éviter toute méprise pendant le suivi de la maladie.
La glucosamine étant produite à partir de la carapace de crustacés, on conseille de ne pas en consommer en cas d'allergie aux crustacés, même si une étude récente a démontré qu’il n’existait pas de réel danger.
Quant aux effets indésirables, il en existe bien quelques uns : la prise de glucosamine peut causer de légers troubles gastro-intestinaux et de rares cas d'asthme.
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